К фармацевтическим отходам относят просроченные, неиспользованные, пролитые или зараженные фармацевтические средства и препараты в твердом или жидком состоянии. Также к таким отходам относят подлежащие уничтожению наркотические средства и неиспользованные вакцины. Фармацевтические отходы образуются на фармацевтических производствах, в больницах, аптеках и ветеринарных лечебницах, то есть во всех учреждениях, где применяются лекарственные препараты и вакцины.

Вся продукция фармацевтических заводов представляет собой химические вещества разной степени токсичности. По этой причине утилизация и обезвреживание фармацевтических отходов должны производить специализированные компании, которые имеют лицензию на осуществление этого вида деятельности. Утилизация продукции фармакологии путем ее сжигания приводит к серьезному загрязнению атмосферы, гидросферы и почвы токсичными веществами, а, следовательно,  к серьезным проблемам и заболеваниям населения.  В настоящее время активно используется метод дробления лекарственных средств в таком устройстве как шредер. После дробления крошку из лекарств смешивают с другими отходами и используют в производстве цемента и бетона. Такой способ утилизации позволяет сделать утилизацию фармацевтических отходов экологически безопасной.

Продукция фармацевтических производств с истекшим сроком годности является одним из наиболее специфических видов отходов. Вывоз на обычную свалку или полигон таких отходов категорически запрещается. Вывоз фармацевтических отходов должны осуществлять специализированные организации, которые обладают соответствующей технической базой и пакетом необходимой разрешающей документации. Вывозить фармацевтическую продукцию с истекшим сроком годности и не пригодную к использованию в герметичных контейнерах.  Для жидких средств фармацевтического производства используется стеклянная тара, которая плотно закрывается, обеспечивающая герметичность. Если вывозится большой объем фармацевтических отходов, то необходимо составить на них паспорт и оформить номенклатурный список, а также составить перечень вывозимых отходов.

Помещения, где хранятся фармацевтические отходы, должны соответствовать определенным требованиям по санитарным, пожарным и другим нормам. Наиболее оптимальным вариантом для этой цели является использование отдельного здания либо изолированного помещения, имеющего отдельный вход. Нельзя допускать смешанное хранение фармацевтических отходов на одном поддоне или стеллаже вместе с другими категориями отходов, а также их хранение на полу. Помещение для хранения фармацевтической продукции должно быть чистым, сухим и хорошо проветриваемым. Кроме этого, оно должно быть оборудовано термометрами, гигрометрами, вентиляционной и противопожарной системами, а также специальными средствами и инвентарем для перемещения фармацевтической продукции.